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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
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Fecha : |
30/05/2019 |
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Actualizado : |
20/04/2020 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Autor : |
ABREO, E.; ALTIER, N. |
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Afiliación : |
EDUARDO RAUL ABREO GIMENEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; NORA ADRIANA ALTIER MANZINI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay. |
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Título : |
Pangenome of Serratia marcescens strains from nosocomial and environmental origins reveals different populations and the links between them. |
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Fecha de publicación : |
2019 |
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Fuente / Imprenta : |
Scientific Reports, 1 December 2019, Volume 9, Issue 1, Article number 46. OPEN ACCESS. Doi: https://doi.org/10.1038/s41598-018-37118-0 |
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ISSN : |
2045-2322 |
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DOI : |
10.1038/s41598-018-37118-0 |
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Idioma : |
Inglés |
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Notas : |
Article history: Received: 25 July 2018 // Accepted: 30 November 2018 // Published online: 10 January 2019.
Author Contributions: Eduardo Abreo and Nora Altier designed the study, E.A. performed the genomic analysis and wrote the manuscript, E.A. and N.A. analyzed the results. Both authors reviewed the manuscript. |
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Contenido : |
ABSTRACT.
Serratia marcescens is a Gram-negative bacterial species that can be found in a wide range of environments like soil, water and plant surfaces, while it is also known as an opportunistic human pathogen in hospitals and as a plant growth promoting bacteria (PGPR) in crops. We have used a pangenome-based approach, based on publicly available genomes, to apply whole genome multilocus sequence type schemes to assess whether there is an association between source and genotype, aiming at differentiating between isolates from nosocomial sources and the environment, and between strains reported as PGPR from other environmental strains. Most genomes from a nosocomial setting and environmental origin could be assigned to the proposed nosocomial or environmental MLSTs, which is indicative of an association between source and genotype. The fact that a few genomes from a nosocomial source showed an environmental MLST suggests that a minority of nosocomial strains have recently derived from the environment. PGPR strains were assigned to different environmental types and clades but only one clade comprised strains accumulating a low number of known virulence and antibiotic resistance determinants and was exclusively from environmental sources. This clade is envisaged as a group of promissory MLSTs for selecting prospective PGPR strains.
© 2019, The Author(s). |
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Palabras claves : |
ANTIBIOTIC RESISTANCE; CLADISTICS; GENOME; GENOTYPE; SERRATIA MARCESCENS; VIRULENCE. |
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Asunto categoría : |
H20 Enfermedades de las plantas |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/12716/1/Abreo-Altier.-2019.-Scientific-Reports.-10.1038-s41598-018-37118-0.pdf
https://www.nature.com/articles/s41598-018-37118-0.pdf
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Marc : |
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520 $aABSTRACT. Serratia marcescens is a Gram-negative bacterial species that can be found in a wide range of environments like soil, water and plant surfaces, while it is also known as an opportunistic human pathogen in hospitals and as a plant growth promoting bacteria (PGPR) in crops. We have used a pangenome-based approach, based on publicly available genomes, to apply whole genome multilocus sequence type schemes to assess whether there is an association between source and genotype, aiming at differentiating between isolates from nosocomial sources and the environment, and between strains reported as PGPR from other environmental strains. Most genomes from a nosocomial setting and environmental origin could be assigned to the proposed nosocomial or environmental MLSTs, which is indicative of an association between source and genotype. The fact that a few genomes from a nosocomial source showed an environmental MLST suggests that a minority of nosocomial strains have recently derived from the environment. PGPR strains were assigned to different environmental types and clades but only one clade comprised strains accumulating a low number of known virulence and antibiotic resistance determinants and was exclusively from environmental sources. This clade is envisaged as a group of promissory MLSTs for selecting prospective PGPR strains. © 2019, The Author(s).
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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Identificación
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Origen
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Clasificación
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Cutter
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Registro
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Volumen
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Estado
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA La Estanzuela. |
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Fecha actual : |
09/10/2019 |
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Actualizado : |
09/10/2019 |
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Tipo de producción científica : |
Libros |
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Autor : |
AGUERRE, M.; CAJARVILLE, C.; LA MANNA, A.; CAVESTANY, D.; MENDOZA, A.; MATTIAUDA, D.; CARRIQUIRY, M.; REPETTO, J.L.; MEIKLE, A.; CHILIBROSTE, P. |
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Afiliación : |
MARTÍN AGUERRE, Ejercicio Liberal, Coordinador Componente I – Red Tecnológica Sectorial.; CECILIA CAJARVILLE, Departamento de Nutrición Animal, Facultad de Veterinaria, UdelaR.; ALEJANDRO FRANCISCO LA MANNA ALONSO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; DANIEL CAVESTANY BOCKING, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay./Departamento de Reproducción Animal, Facultad de Veterinaria, UdelaR.; ALEJANDRO FRANCISCO MENDOZA AGUIAR, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay./ Departamento de Bovinos, Facultad de Veterinaria, UdelaR.; DIEGO MATTIAUDA, Departamento de Producción Animal y Pasturas, Facultad de Agronomía, UdelaR.; MARIANA CARRIQUIRY, Departamento de Producción Animal y Pasturas, Facultad de Agronomía, UdelaR.; JOSE LUIS REPETTO, Departamento de Bovinos, Facultad de Veterinaria, UdelaR.; ANA MEIKLE, Laboratorio de Endocrinología y Metabolismo Animal, Facultad de Veterinaria, UdelaR.; PABLO CHILIBROSTE, Departamento de Producción Animal y Pasturas, Facultad de Agronomía, UdelaR. |
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Título : |
Estrategias de alimentación de vacas lecheras en pastoreo: ¿qué hemos aprendido de los sistemas comerciales y qué hemos generado desde la investigación en Uruguay?. |
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Fecha de publicación : |
2016 |
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Fuente / Imprenta : |
Montevideo, UY: ANII, UdelaR, CONAPROLE, INIA, CRI, INIALE, 2016. |
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Páginas : |
55 p. |
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Idioma : |
Español |
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Contenido : |
Consideraciones finales:
El presente trabajo integra información proveniente de 43 publicaciones que resultan de investigaciones realizadas a nivel nacional en Facultad de Agronomía, Facultad de Veterinaria, INIA La Estanzuela y predios comerciales en los últimos 20 años. Involucran la participación de investigadores senior, investigadores en formación, estudiantes de grado, maestría y doctorado y de asesores particulares, lo que sin dudas constituye una gran fortaleza para el País en su conjunto. El análisis
de la información publicada, resalta la potencia de estrategias de investigación bien integradas con el sector productivo, con canales permanentes de comunicación de ida y vuelta, donde se genere, analice y comparta información tanto en los sistemas de producción como en las estaciones experimentales.
Las publicaciones revisadas brindan referencias claras de cómo algunos criterios de manejo del pastoreo y distintos sistemas de alimentación impactan a nivel productivo, reproductivo, endócrino/metabólico y en la calidad del producto final de vacas lecheras manejadas en condiciones similares a las observadas en sistemas comerciales de producción. Así, el manejo de pasturas con buena disponibilidad y altura de la masa de forraje al momento del ingreso al pastoreo (>1500 kg MS/ha y 15-18 cm) con asignaciones de forraje por animal no limitantes (>15 kg MS/animal, por encima de 4 cm del suelo) permitirán una buena eficiencia de cosecha y promoverán altas tasas de consumo por parte de los animales. Cuando la cantidad de forraje en el sistema es limitante, priorizar sesiones cortas de pastoreo en la tarde determinará una cosecha de forraje eficiente con una mayor proporción del tiempo total en la pastura dedicado al pastoreo, logrando bocados más pesados y mayores tasas de consumo. En estas situaciones es posible combinar pasturas con la suplementación de RTM y tener resultados productivos similares al de animales alimentados únicamente con RTM contribuyendo a la generación de un producto final diferenciado, con un perfil de ácidos grasos benéficos para la salud humana, lo que constituye una ventaja comparativa respecto a los sistemas de alimentación basados únicamente en RTM. La mayor disponibilidad de reservas corporales al parto determina una mayor producción de leche corregida por grasa. Así mismo, una mayor condición corporal al parto (CC ? 3) se asocia con anestros más cortos tanto en vacas como en vaquillonas. El nivel de alimentación preparto puede mejorar la producción y tiene incidencia en acortar el anestro posparto. Sin embargo, estas respuestas estarán condicionadas a efectos sobre la condición corporal y el estatus endocrino/metabólico durante el pre y postparto de los animales.Si bien es mucho lo que se ha avanzado en la generación de conocimiento a nivel nacional aún quedan muchos aspectos que requieren más y mejor investigación. Así, diseñar sistemas de alimentación simples, lograr un mejor ?menú diario? para las vacas en producción, mejores combinaciones de RTM y pasturas entendiendo que ?tipos? de fibra ofrecen mejores respuestas productivas, que tecnologías o técnicas pueden mejorar el valor nutritivo de los forrajes conservados, como se integran los subproductos agroindustriales en este tipo de manejos, como impacta en el costo energético de los animales el traslado a la pastura y la actividad de pastoreo, el nivel y tipo de infraestructura necesaria, integrando aspectos de salud, bienestar animal e impacto ambiental, son algunos de los desafíos para el futuro cercano. MenosConsideraciones finales:
El presente trabajo integra información proveniente de 43 publicaciones que resultan de investigaciones realizadas a nivel nacional en Facultad de Agronomía, Facultad de Veterinaria, INIA La Estanzuela y predios comerciales en los últimos 20 años. Involucran la participación de investigadores senior, investigadores en formación, estudiantes de grado, maestría y doctorado y de asesores particulares, lo que sin dudas constituye una gran fortaleza para el País en su conjunto. El análisis
de la información publicada, resalta la potencia de estrategias de investigación bien integradas con el sector productivo, con canales permanentes de comunicación de ida y vuelta, donde se genere, analice y comparta información tanto en los sistemas de producción como en las estaciones experimentales.
Las publicaciones revisadas brindan referencias claras de cómo algunos criterios de manejo del pastoreo y distintos sistemas de alimentación impactan a nivel productivo, reproductivo, endócrino/metabólico y en la calidad del producto final de vacas lecheras manejadas en condiciones similares a las observadas en sistemas comerciales de producción. Así, el manejo de pasturas con buena disponibilidad y altura de la masa de forraje al momento del ingreso al pastoreo (>1500 kg MS/ha y 15-18 cm) con asignaciones de forraje por animal no limitantes (>15 kg MS/animal, por encima de 4 cm del suelo) permitirán una buena eficiencia de cosecha y promoverán altas tasas de consumo por ... Presentar Todo |
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Thesagro : |
LECHERÍA; URUGUAY. |
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Asunto categoría : |
-- |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/13477/1/RevistaEstrategiasdealimentacion.pdf
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Marc : |
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300 $a55 p.
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